Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIG1P18858 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIG1P18858 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIG1P18858 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIG1P18858 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIG1P18858 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIG1P18858 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIG1P18858 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIG1P18858 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIG1P18858 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIG1P18858 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LIG1P18858 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIG1P18858 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIG1P18858 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIG1P18858 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIG1P18858 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIG1P18858 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIG1P18858 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIG1P18858 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIG1P18858 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIG1P18858 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LIG1P18858 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIG1P18858 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIG1P18858 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIG1P18858 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LIG1P18858 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIG1P18858 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LIG1P18858 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIG1P18858 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LIG1P18858 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIG1P18858 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LIG1P18858 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIG1P18858 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIG1P18858 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LIG1P18858 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIG1P18858 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIG1P18858 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIG1P18858 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms