Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB6P18564 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGB6P18564 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms