Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNNT1P13805 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNT1P13805 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNT1P13805 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms