Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BMP4P12644 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BMP4P12644 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BMP4P12644 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP4P12644 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BMP4P12644 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP4P12644 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BMP4P12644 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BMP4P12644 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BMP4P12644 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BMP4P12644 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BMP4P12644 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms