Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OPN1MW3P0DN78 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OPN1MW3P0DN78 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.3 ms