Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC166P0CW27 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC166P0CW27 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms