Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB2O95900 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB2O95900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB2O95900 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms