Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22BO75396 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22BO75396 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms