Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHACTR2O75167 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHACTR2O75167 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms