Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC19A2O60779 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC19A2O60779 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms