Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KIF28PB7ZC32 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KIF28PB7ZC32 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KIF28PB7ZC32 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms