Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRR3A8MPY1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRR3A8MPY1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms