Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RGPD3A6NKT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RGPD3A6NKT7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RGPD3A6NKT7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RGPD3A6NKT7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms