Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRD1A4D1F6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRD1A4D1F6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms