Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC66A2RUB6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC66A2RUB6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms