Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APEX2Q9UBZ4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APEX2Q9UBZ4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms