Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CPNE7Q9UBL6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms