Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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