Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC7Q96M83 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC7Q96M83 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms