Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms