Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms