Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms