Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAV1Q03135 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms