Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUCB1Q02818 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms