Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms