Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2AP24928 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2AP24928 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms