Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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