Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PTPRBP23467 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPRBP23467 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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