Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBDO15205 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBDO15205 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBDO15205 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms