Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDM6BO15054 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms