Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms