Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VAMP8Q9BV40 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms