Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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