Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM72Q6ZMU5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms