Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COBLL1Q53SF7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COBLL1Q53SF7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms