Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RTN1Q16799 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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RTN1Q16799 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RTN1Q16799 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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