Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms