Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBASH3AP57075 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms