Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BLMP54132 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BLMP54132 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BLMP54132 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms