Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA7P31268 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms