Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD10P28358 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms