Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C18orf8Q96DM3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms