Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLR1Q15399 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLR1Q15399 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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