Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF6Q13247 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF6Q13247 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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