Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UFM1P61960 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UFM1P61960 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UFM1P61960 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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