Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3BMM5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3BMM5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3BMM5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms