Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFHD1Q9BUP0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 765.6 ms