Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN1Q14699 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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