Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM29Q14134 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM29Q14134 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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