Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NAE1Q13564 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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NAE1Q13564 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NAE1Q13564 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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